कटहल के पौधों में नर व मादा फूल अलग-अलग होते हैं। सिर्फ मादा फूलों में ही फल लगते हैं नर फूलों में नहीं। कम फूलों में फल लगने का यही कारण है।
– नर फूल पौधे की नई कोमल टहनियों में लगते हैं पत्ती के साथ या मादा फूलों के ऊपर लगते हैं। नर फूलों में पीले चिपचिपे परागकण देखे जा सकते हैं। जिनसे मीठी सुगंध निकलती है, जिसमें कीट आकर्षित होते हैं। यह 5 से 10 से.मी. लंबे व 2.0 से 4.5 से.मी. चौड़े रहते हैं। इनमें बांझ फूल भी रहते हैं।
– मादा फूल नर फूलों से बढ़े रहते हैं वह मोटे व छोटे डंठल से पौधे की पुरानी शाखाओं तथा मुख्य तने से निकलते हैं। ये बेलनाकार, 5 से 15 से.मी. लंबे व 3.0 से 4.5 से.मी. चौड़े रहते हैं। मादा फूल ही फल में परिवर्तित होते हैं